Licenciado en Ciencias Químicas por la Universidad Complutense de Madrid, en 1951, y Doctor por la misma Universidad en 1954, tras una estancia en Uppsala (Suecia), en el laboratorio del Prof. Arne Tiselius, Premio Nobel de Química en 1948, se incorpora a su Instituto de origen, el Instituto de Química “Alonso Barba” del CSIC, donde era Colaborador Científico desde 1955, y en el que pasará a ser Jefe de la Sección de Enzimoquímica.

En 1966, se traslada al recién creado Centro Nacional de Química Orgánica, donde continuó al frente de la Sección de Química de Enzimas, más tarde denominada Unidad de Química Orgánica Biológica, ocupando también el cargo de Vicedirector del Instituto durante el período 1977-1979, siendo entonces Director el Prof. Francisco Fariña. Es aquí donde desarrollará su carrera científica hasta su jubilación en 1993.

La obra científica del Prof. Fernández Álvarez se enmarca en la frontera de la Química Orgánica clásica y la Bioquímica experimental. Su labor investigadora comienza con el desarrollo de su Tesis Doctoral sobre fosfatasas, interesándose después por otras enzimas y, en general, por los mecanismos de las reacciones enzimáticas. Estudia la cinética de los procesos catalíticos “in vitro” y la inhibición de estos procesos por sustancias exógenas (inhibidores), en la perspectiva de conseguir nuevos agentes farmacológicos de interés terapéutico. También estudió la naturaleza de los centros activos de diversas enzimas (fosfatasas, aminooxidasas, catecol-O-metiltransferasas, etc.). Otra de sus contribuciones fue la traducción al español, junto con Francisco Fariña, del famoso “libro azul” de la IUPAC, con las reglas de nomenclatura.

Publicaciones representativas

• Estremera, H. R.; Fernández-Álvarez, E.; Lora-Tamayo, M. Phosphatases.  XX.  Phosphoesterase activity of imidazole and its derivatives.  Anales de la Real Sociedad Española de Física y Química, Serie B:  Química 1966, 62(9-10), 1023-1036.
• Arenal, I.; Bernabé, M.; Fernández-Álvarez, E.; Penadés, S. Synthesis of (E)- and (Z)-1-amino-2-aryl(methyl)cyclopropanecarboxylic acids via spirooxazolones.  Synthesis 1985, (8), 773-775.
• Pérez, R. A.; Fernández-Álvarez, E.; Nieto, O.; Piedrafita, F. J. Dihydroxynitrobenzaldehydes and hydroxymethoxynitrobenzaldehydes:  synthesis and biological activity as catechol-O-methyltransferase inhibitors. J. Med. Chem. 1992, 35(24), 4584-4588. 
• Pérez, V.; Marco, J. L.; Fernández-Álvarez, E.; Unzeta, M. Relevance of benzyloxy group in 2-indolyl methylamines in the selective MAO-B inhibition. British J. Pharmacol. 1999, 127(4), 869-876.